通常のアミノ酸とタンパク質合成
生物のタンパク質構造に最も頻繁に現れるアミノ酸は、通常のアミノ酸またはタンパク質構成アミノ酸と呼ばれます。自然界では500種類以上のアミノ酸が知られていますが、私たちが普通と呼んでいるのは20種類だけです。それらに加えて、たまにあるものと呼ばれるいくつかのまれなものがあります。これらは一般に、タンパク質鎖に組み込まれた後の通常のものの代謝に由来します。たとえばコラーゲンでは、2つの通常のアミノ酸であるリジンとプロリンがヒドロキシル化された形で見られます(ヒドロキシプロリンとヒドロキシリシン)。
他の非通常のアミノ酸のほとんどは、主にタンパク質の性質の酵素とホルモン、またはむしろペプチドの構成に含まれます(そのように見なされるためには、タンパク質は100を超えるアミノ酸で構成されている必要がありますが、それぞれオリゴとポリペプチドを形成する2から9と10から100で十分です)。
20種類の普通のアミノ酸の中で記憶されています
アラニン、アルギニン、アスパラギン、アスパラギン酸、システイン、グリシン、グルタミン酸、グルタミン、ヒスチジン、イソロイシン、ロイシン、リジン、メチオニン、フェニルアラニン、プロリン、セリン、スレオニン、トリプトファン、チロシン、バリン
非通常のアミノ酸の例は次のとおりです。
カルニチン(ミトコンドリア内の長鎖脂肪酸の輸送に関与し、そこでエネルギーを生成するために使用されます);
オルニチン、シトルリン、ホモシステイン(アミノ酸の代謝に参加する-尿素回路);
ヒドロキシプロリンとヒドロキシリシン(これらはコラーゲンといくつかのタンパク質の組成の一部です);
サルコシン(またはメチルグリシン)。
一部のアミノ酸は、商業的または薬理学的に重要な場合もあります。
- グルタミン酸ナトリウムは、食品業界で調味料として使用されています(ブイヨンキューブを参照)。
- L-ジヒドロキシフェニルアラニン(L-DOPA)は、パーキンソン病の治療に使用される薬です。
- 5-ヒドロキシトリプトファン(5-HTP)は、フェニルケトン尿症(特定の酵素欠損のために必須アミノ酸であるフェニルアラニンの使用を妨げる遺伝性代謝性疾患;組織内のフェニルアラニンの蓄積)に関連する神経学的症状の治療に使用されています。重度の皮膚および神経学的損傷の原因です)。
植物やバクテリアは、ナイシンやアラメチシンなどのペプチド抗生物質に含まれる特定のアミノ酸を生成することができます。
必須アミノ酸
20種類の通常のアミノ酸のいくつかは、他の化合物から体内で合成することはできないため、必須と呼ばれていますが、食物と一緒に摂取する必要があります。
ヒトの場合、これらはフェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、リジン、メチオニン、スレオニン、トリプトファン、バリン、そして子供ではヒスチジンとアルギニンです。
通常のアミノ酸、化学的性質
Rラジカル(それほど長くない鎖を形成する原子のグループ)の化学的特性に基づいて、アミノ酸はさまざまなカテゴリーに分類できます。
無極性Rのアミノ酸(水素結合を形成できない):
脂肪族鎖を持つ:アラニン、ロイシン、イソロイシン、バリン、プロリン
芳香族鎖:フェニルアラニン、トリプトファン
硫黄原子を含む鎖を持つ:メチオニン
極性Rのアミノ酸:
OH基あり:セリン、スレオニン、チロシン
SHグループあり:システイン
CO-NH2基の場合:アスパラギン、グルタミン
Hを含む:グリシン(唯一の非キラルアミノ酸)
塩基性Rのアミノ酸:
リシン、アルギニン、ヒスチジン
酸Rを含むアミノ酸:
グルタミン酸、アスパラギン酸